Yeni bir sanal sunucu oluşturulduğunda eklenen Apache yönergelerini tamamen özelleştirmek mümkündür. Değişken değiştirme, tüm standart Virtualmin şablon değişkenleri için gerçekleştirilir. Bazı güvenlik sorunları olduğu için Apache direktiflerine dikkat edilmelidir. Apache yapılandırması hakkında daha fazla ayrıntı için Apache belgelerine ve daha az derecede Webmin belgelerinin Apache bölümlerine başvurabilirsiniz.