Cette option spécifie si le propriétaire du domaine aura accès au module Webmin des commandes personnalisées. Avec le module Custom Commands, vous pouvez étendre Webmin sans avoir à programmer un nouveau module. Une commande personnalisée peut exécuter n'importe quelle commande sur le système avec les options que vous spécifiez. Le remplacement de variable est également disponible afin que l'utilisateur exécutant la commande puisse fournir des arguments d'entrée ou d'option à la commande, et il est possible d'exécuter la commande en tant qu'utilisateur Webmin connecté ou en tant que n'importe quel utilisateur du système (y compris root, mais être attention à ça!). Il s'agit d'une fonctionnalité très puissante de Webmin, vous permettant d'ajouter de nouveaux "boutons" qui exécutent des fonctions spécifiques à votre environnement, ou auxquels certains de vos utilisateurs peuvent avoir besoin d'accéder.