Nye domener (som ikke eies av eksisterende domeneeiere) vil ligge i en underkatalog i hjemkatalogen som er spesifisert over. Som standard vil katalognavnet samsvare med brukernavnet og ligge direkte i basekatalogen. Du kan også spesifisere et spesielt katalognavn, hvis du for eksempel vil holde standard systembrukere atskilt fra domenekontobrukere. I et slikt tilfelle kan du plassere Virtualmin-domenene i "/ home / domains / $USER".